大量数据怎么存与取较快？

请问一个问题有大小75kb的txt文件5000千万个，放在一个5T移动硬盘里，该怎么放较好呢？如果把这硬盘生成6000个文件夹每个文件夹放1万个txt文件，用于存与取，电脑读取硬盘里的速度会不会有太大影响  一般配置电脑，谢谢！

电脑性能

电脑型号	宏碁 Founder PC 台式电脑  (扫描时间：2010年07月29日)
操作系统	Windows XP 专业版 32位 SP3 ( DirectX 9.0c )

处理器	AMD Athlon(速龙) II X4 640 四核
主板	精英 MCP61PQ-CM ( Nvidia nForce 430 )
内存	2 GB ( 商丞 DDR3 1333MHz )
主硬盘	金士顿 SV300S37A120G ( 120 GB / 固态硬盘 )
显卡	ATI Radeon HD 5450 ( 蓝宝石 )
显示器	Topview(冠捷) LCD2150 FGC83 ( 21.7 英寸  )
声卡	瑞昱 ALC662 @ Nvidia nForce 430  高保真音频
网卡	瑞昱 RTL8168/8111/8112 Gigabit Ethernet Controller / 精英
会不会卡死电脑？或出现什么问题...
谢谢！